Linux さんの OS 全体での割り当て済みファイルハンドル数は /proc/sys/fs/file-nr にある数字の一つ目です。これをみて OS 全体での割り当てどんなもんかなあと調整してやると良いです。ファイルハンドル、ファイルディスクリプタ、これは同じものなのかな…